Q.ファイル名がエクスプローラの表示と違う

大文字と小文字が異なる場合は、オプションの基本設定で「すべて大文字のファイル名を使用する」のチェックを変更してください。

拡張子が2重に表示されてしまう場合は、エクスプローラの設定で「登録されているファイルの拡張子は表示しない」のチェックを外すようにしてください。NextFTPで表示されているのが正式なファイル名です。